Este é um dos mais famosos programas para visualização de modelos moleculares a 3 dimensões. O programa é compatível a grande maioria de tipos de ficheiros de representação molecular tridimensional, não sendo no entanto possível criar estes ficheiros, e está disponível num grande número de plataformas.
O programa está dividido em duas janelas: uma de visualização, onde apenas se tem acesso a um reduzido número de opções; e uma janela em forma de linha de comandos que para além de definir parâmetros de visualização permite retirar informações sobre a própria estrutura da molécula. Esta característica é particularmente útil no caso de moléculas biológicas sendo possível, entre outras, ter acesso à sequência de aminoácidos ou nucleótidos de uma cadeia, o número de cadeias de uma estrutura, bem como a visualização da estrutura secundaria de uma cadeia polipeptídica.
Trabalhar com a linha de comandos pode ser trabalhoso, por isso existe o RasTop (1.7Mb) que é uma interface gráfica, que facilita a maior parte das operações efectuadas na linha de comandos.
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